《黑客帝国动画版》由9段以《黑客帝国》系列电影世界观为基础生发出的短片组成，各篇的角度与风格各异，制作班底汇聚了日本、美国、韩国三地的动画精英。《机器复兴》讲述了MATRIX的历史。机器人不堪人类恶劣对待，终于反抗并将人类化为能源。
霧の総旗艦・ヤマトを目指していたイ401の艦長・千早群像は、父、翔像の生存を知ると、父との再会という新たな目的を抱き北極海へと向かう。一方、メンタルモデルとして成長してきたイオナは、自らの出自を告げられたことでその過去に苦しめられてしまう。
繁华大都会日本东京，迎来了一年一度的愚人节。有交流障碍的医院清洁工新田步（户田惠梨香 饰）鼓起勇气打电话给外科医生牧野亘（松坂桃李 饰），宣布自己已经怀孕的事实。谁知对方矢口否认孩子和自己相关，更当成一个恶劣的玩笑，之后继续招蜂引蝶。
